Stipendio e ammortamento (che riguarda esclusivamente il cartellino) sono due cose separate.
La squadra che prende il giocatore in prestito mette a bilancio stipendio (o parte di esso) e eventuale costo del prestito; chi lo dà in prestito vede continuare l'ammortamento, toglie dal bilancio lo stipendio (o la parte di stipendio) pagato dall'altra società e mette l'eventuale introito relativo al prestito.

Se ho capito bene funziona così.